Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01667 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P01667 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01667 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01667 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01667 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01667 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01667 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms