Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms