Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp1O89090 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp1O89090 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp1O89090 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms