Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4aO89084 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4aO89084 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms