Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CpdO89001 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CpdO89001 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CpdO89001 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CpdO89001 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CpdO89001 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CpdO89001 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CpdO89001 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CpdO89001 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CpdO89001 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CpdO89001 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpdO89001 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpdO89001 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpdO89001 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpdO89001 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpdO89001 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms