Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd7O88665 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd7O88665 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms