Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl22O88430 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms