Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme6O88425 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms