Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtssO70370 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtssO70370 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtssO70370 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CtssO70370 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtssO70370 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtssO70370 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtssO70370 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtssO70370 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms