Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1bO70237 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1bO70237 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms