Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms