Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms