Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pja1O55176 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pja1O55176 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms