Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx3O55144 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx3O55144 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms