Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms