Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrxO55103 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrxO55103 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrxO55103 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrxO55103 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrxO55103 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrxO55103 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms