Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms