Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pole2O54956 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole2O54956 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms