Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms