Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NlkO54949 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NlkO54949 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NlkO54949 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NlkO54949 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NlkO54949 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NlkO54949 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms