Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms