Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EdaO54693 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EdaO54693 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EdaO54693 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EdaO54693 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EdaO54693 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EdaO54693 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EdaO54693 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms