Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NudcO35685 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NudcO35685 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NudcO35685 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NudcO35685 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NudcO35685 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NudcO35685 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NudcO35685 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NudcO35685 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NudcO35685 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms