Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc1a6O35544 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a6O35544 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms