Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TnxbO35452 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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