Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms