Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc1O35379 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms