Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna4O35343 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna4O35343 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms