Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad6O35182 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad6O35182 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms