Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms