Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms