Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap23O09044 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Snap23O09044 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snap23O09044 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap23O09044 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap23O09044 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap23O09044 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap23O09044 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms