Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms