Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC117090L7N257 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC117090L7N257 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms