Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20939L7N243 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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