Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms