Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccer2J3QPU5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms