Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10428J3QNV7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10428J3QNV7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10428J3QNV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10428J3QNV7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10428J3QNV7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms