Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc180J3QNE4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc180J3QNE4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc180J3QNE4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc180J3QNE4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms