Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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