Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20873J3QMQ9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms