Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21411J3KMS0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21411J3KMS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms