Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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