Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms