Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms