Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms