Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms