Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp72F8VQC1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms