Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms