Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ercc6F8VPZ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms